Vytvorila sa vyvetrávaním kmeňa zuhoľnateného stromu a následným opadávaním horniny zo stropu. Jaskyňa je vytvorená v ryodacitových tufoch , v ktorých na území Cerovej vrchoviny nie sú až také zriedkavé zvyšky silicifikovaných alebo zuhoľnatených stromov. Takéto zvyšky sa nájdu napr. pri Kalonde a na neďaleko ležiacej svetoznámej paleontologickej lokalite Ipolytarnóc v severnom Maďarsku. Dôvodom výskytu týchto zvyškov je sopečná činnosť na začiatku mladších treťohôr. Z neznámej, ale neďaleko ležiacej sopky sa po výbuchu začal valiť blízko zeme hustý horúci oblak, nasýtený sopečným popolom a prachom tak intenzívne, že ničil rastlinstvo a váľal stromy. Vulkanický popol a piesok čoskoro zakryl všetko v niekoľko metrovej hrúbke. Kusy kmeňov stromov začali tlieť bez prístupu kyslíka, iné presiakli kremitým roztokom vyluhovaného z vrstiev sopečného popola. Zvyšky pochovaných zuhoľnatených alebo prekremenených stromov teda takto odpočívali niekoľko miliónov rokov spolu s odtlačkami rastlín.